为全球乳酸菌产学研树立“数据桥梁” 内农大张平和团队建成全球最酸菌基因组数据库

发布时间:2024-03-11 17:20:18 来源:乐鱼APP

  破解6.2万余个乳酸菌基因组,创始性地整合菌种资源、基因组信息、临床试验数据等要害目标对乳酸菌进行高效发掘,根据大数据和人工智能算力为乳酸菌产学研开发使用树立里程碑式的“数据桥梁”,张平和团队做到了。

  近来,内蒙古农业大学教授张平和团队历时5年建造的乳酸菌基因组数据库iLABdb正式建成上线(,成为现在全球最大的乳酸菌基因组、功用研讨数据同享数据库平和台。使用基因组技能为乳酸菌资源注入立异生机,这一严重成果的发布,展示了我国在微生物学研讨范畴的领头羊和世界影响力,也将为全球乳酸菌研讨与工业高质量开展奉献活跃力气。

  iLABdb是凭借前沿的生物信息学技能和先进的数据剖析算法树立的一个根据Web的归纳乳酸菌基因组数据同享渠道,数据库包含6.2万余个乳酸菌基因组及相关元数据,包含1.1万余个新测序的乳酸菌基因组,由“青城之光”高性能核算公共服务渠道供给算力资源支撑。

  乳酸菌体系发育联系杂乱,菌株间功用和代谢差异极大,难以经过传统试验办法体系性地研讨和发掘,这大大约束了乳酸菌的开发与使用功率。张平和介绍,依托渠道,用户可根据实践的需求精确高效地挑选出具有不一样成效的菌株,对食物加工、农业栽培、动物饲养以及生物制药等范畴科学研讨和工业使用含义严重,将最大极限地开释“数据生产力”。

  据了解,乳酸菌作为微生物范畴重要的战略资源,具有广泛的使用价值。张平和带领团队历时34年,从全球6大洲32个国家收集天然发酵乳制品等样品6202份,别离保藏乳酸菌47573株,建成全球最大、品种最全的乳酸菌种质资源库,该资源库当选2022年第一批国家农业微生物种质资源库。依托乳酸菌种质资源库,团队于2018年启动了“乳酸菌万株基因组方案”,使用自建菌种资源库中1.1万株完结测序的乳酸菌全基因组序列,并结合现有公共数据库中5.19万个乳酸菌基因组数据,树立了iLABdb数据库,相关科研成果发表于《Science Bulletin》(《科学通报(英文版)》)。